El CINAE utiliza los medios tecnológicos y las aplicaciones disponibles para la interacción entre los alumnos y los docentes de la Escuela de Comando y Estado Mayor, la Escuela de Perfeccionamiento de Oficiales, Cursos Especiales, Escuela Náutica y la Escuela de Formación de Suboficiales de la Armada. Las herramientas digitales de enseñanza - aprendizaje se desarrollan a través de la plataforma MOODLE, además de otras tales como CLASSROOM, Microsoft Teams y formularios de Google Drive.
El Comando de Institutos Navales de Enseñanza tiene como Misión, Orientar, Coordinar Y Supervisar la Enseñanza e Instrucción Naval, con la finalidad de contribuir en la preparación del Personal para el Empleo del Poder Naval.
Forma lideres altamente competentes referentes en el ámbito naval militar, con principios éticos capaces de conducir y administrar con eficiencia la unidades Componentes de la Armada Paraguaya.